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當前位置:首頁技術文章geneticsignatures 腸道病原篩選試劑盒

geneticsignatures 腸道病原篩選試劑盒

更新時間:2018-06-28點擊次數:2301

Genetic Signatures成立于2001年,由Geoffrey Grigg博士(原澳大利亞聯邦科學與工業研究組織(CSIRO)分子生物學部主任)創立。甲基化分析中使用廣泛的方法是亞硫酸氫鹽法,由Grigg博士在英國劍橋設想,并被減少到CSIRO實驗室的實踐中[1]。初的方法隨后得到改進,這些改進導致了遺傳簽名MethylEasy™DNA亞硫酸氫鈉修飾產品系列的開發和發布。

由于改進的轉化方法和用于胞嘧啶甲基化檢測的應用,發現了一個有趣的發現:通過亞硫酸氫鈉處理微生物DNA能夠將四種核酸堿基還原成僅三個堿基,通過將胞嘧啶轉化為胸腺嘧啶。該技術被稱為3base ™,是我們的EasyScreen ™病原體檢測試劑盒的基石。

此后,遺傳標志開發并商業化了一套基于EasyScreen ™實時PCR的產品,用于常規檢測傳染病。EasyScreen ™產品為醫院和病理實驗室提供了分子工具,可在快速高通量的環境中篩查各種傳染性病原體。

腸道病原篩選試劑盒

胃腸疾病可能由各種各樣的感染因素引起,包括病毒,細菌和原生動物。因此,傳染性胃腸疾病的診斷可能具有挑戰性,并且涉及微生物學,病毒學和寄生蟲學方面的專家。

據估計,澳大利亞每年有1680萬胃腸炎病例,導致醫院急診科就診25萬人,住院15,000人,死亡80人[1]。

為了簡化感染性胃腸道疾病病原體的檢測,我們開發了  EasyScreen™   實時PCR篩選檢測方法,用于所有主要胃腸炎病原體。所有的分析方法都采用通用樣品處理方法,并采用我們之前描述的  3base™  技術  [2]。

傳統的胃腸炎診斷在某些情況下可能需要長達5天[3]才能提供明確的結果。為了減少這種情況,我們的實驗提供了樣品,可以在3小時內完成結果周轉時間。

遺傳特征  EasyScreen ™腸道病原體檢測試劑盒具有以下優點:

  • 集成的自動化樣品處理方法
    提供從臨床樣品到可報告結果的完整工作流程。通過這種方式,結果也從實驗室到實驗室標準化。
  • 快速檢測
    從樣本到結果3-5小時,與傳統方法相比,少的手工操作時間
  • 內置控制
    由于提取失敗和抑制控制可降低錯誤結果的可能性,因此對結果具有高度的置信度
  • 實時PCR格式
    無PCR后處理,幾乎消除了污染的可能性
  • 全面涵蓋常見病原體
    同時檢測到一種標本制劑導致的22種引起胃腸炎的病原體
  • 開放式平臺
    兼容大多數病理實驗室常見的自動化樣品制備系統和實時PCR儀器

該  EasyScreen™  腸道病原體檢測試劑盒包括:

產品#EasyScreen™套件檢測到微生物
EB001和EB001-HT腸道細菌檢測(i)沙門氏菌屬 
(ii)彎曲桿菌屬(Campylobacter spp。)
(iii)痢疾桿菌/腸內侵襲性大腸桿菌(EIEC)
(iv)小腸結腸炎耶爾森氏菌
(v)產毒的艱難梭菌
(vi)單核細胞增生李斯特菌
EP001和EP001-HT腸道原生動物檢測(i)隱孢子蟲屬
(ii)腸道賈第蟲
(iii)脆弱東部阿米巴
(iv)溶組織內阿米巴,
(v)人芽囊原蟲Blastocystis hominis)
EV002和EV002-HT腸道病毒檢測(i)諾如病毒GI 
(ii)諾如病毒GII 
(iii)星狀病毒
(iv)輪狀病毒A 
(v )沙波病毒
(vi)腸病毒
(vii)博卡
病毒(viii)腺病毒和
(ix)腺病毒(僅40 + 41)
CDD001艱難梭菌檢測致病性艱難梭菌(針對tcdAtcdB
CDD002艱難梭菌反射超致病性艱難梭菌包括 
(i)位置117處的tcdC基因缺失,
(ii)二元毒素基因(cdtA)和
(iii)gyrA基因突變(氟喹諾酮耐藥性)的核糖體027和078 ,

對于HT(384孔格式)試劑盒,所有試劑盒都足夠用于100RXNs或500RXNs。

所有  EasyScreen™  腸道病原體檢測試劑盒可用于使用EasyScreen™  樣品處理試劑盒制備的核酸  。

有關EasyScreen™  工作流程以及與核酸提取和實時PCR平臺的兼容性的更多信息,  請訪問我們的EasyScreen™ 工作流程頁面。 

監管

[1]來源:澳大利亞政府衛生與老齡部,“澳大利亞食源性疾病的年成本”,2006年3月

[2] Baleriola C,Millar D,Melki J,Coulston N,Altman P,Rismanto N和Rawlinson W.2008。新型HPV測試與Hybrid Capture II(hcII)和參考PCR方法的比較顯示高特異性和陽性對13例高危人乳頭瘤病毒感染的預測價值。J. Clin。病毒學雜志。42:22-6 2008

[3] Cunningham SA,Sloan LM,Nyre LM,Vetter EA,Mandrekar J和Pa R. 2010.三小時分子檢測糞便中彎曲桿菌,沙門氏菌,耶爾森氏菌和志賀菌的準確性與培養物一樣高。J. Clin。微。48:2929-33

 

英文信息如下:

ProductEasyScreen™ KitMicroorganisms Detected
EB001 & EB001-HTEnteric Bacteria Detection(i) Salmonella spp. 
(ii) Campylobacter spp. 
(iii) Shigella spp. /Enteroinvasive E.coli (EIEC)
(iv) Yersinia enterocolitica. 
(v) toxigenic C. difficile and 
(vi) Listeria monocytogenes
EP001 & EP001-HTEnteric Protozoan Detection(i) Cryptosporidium spp. 
(ii) Giardia intestinalis 
(iii) Dientamoeba fragilis 
(iv) Entamoeba histolytica and 
(v) Blastocystis hominis
EV002 & EV002-HTEnteric Viral Detection(i) Norovirus GI
(ii) Norovirus GII 
(iii) Astrovirus 
(iv) Rotavirus A 
(v) Sapovirus
(vi) Enterovirus
(vii) Bocavirus
(viii) Adenovirus and 
(ix) Adenovirus (40 + 41 only)
CDD001C. difficile DetectionToxigenic C. difficile (targets both tcdA and tcdB)
CDD002C. difficile ReflexHypervirulent C. difficile incl. ribotype 027 & 078 targeting: (i) tcdC gene deletion at position 117, (ii) binary toxin gene (cdtA) and (iii) gyrA gene mutation (fluoroquinolone resistance)

 

 

對于HT(384孔格式)試劑盒,所有試劑盒都足夠用于100RXNs或500RXNs

所有  EasyScreen™  病原體檢測試劑盒都可用于使用EasyScreen™  樣品處理試劑盒準備的  樣品。

有關EasyScreen™  工作流程以及與核酸提取和實時PCR平臺的兼容性的更多信息,  請訪問我們的  EasyScreen™  工作流程頁面。

 

 

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