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trilinkbiotech免疫沉淀產(chǎn)品

更新時(shí)間:2020-08-31點(diǎn)擊次數(shù):1422

 

免疫沉淀

TriLink提供了一個(gè)3'iCLIP底漆,用于iCLIP應(yīng)用程序。紫外線交聯(lián)免疫沉淀(CLIP)是一種闡明RNA與蛋白質(zhì)相互作用的強(qiáng)大技術(shù)。標(biāo)準(zhǔn)協(xié)議通常采用標(biāo)記的銜接子來(lái)可視化蛋白質(zhì)-RNA復(fù)合物。該方法涉及RNA與蛋白質(zhì)的不可逆交聯(lián),免疫沉淀,5'和3'銜接子的連接,逆轉(zhuǎn)錄,后是PCR擴(kuò)增。不幸的是,逆轉(zhuǎn)錄酶無(wú)法讀取交聯(lián)區(qū)域,這會(huì)產(chǎn)生截短的cDNA,而沒(méi)有啟動(dòng)PCR擴(kuò)增所需的3'和5'銜接子。

CLIP方法的一種變化,單個(gè)核苷酸分辨率的UV交聯(lián)和免疫沉淀(iCLIP)通過(guò)使用預(yù)腺苷酸化引物(iCLIP引物)和逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的環(huán)化來(lái)解決此問(wèn)題。該方法也將結(jié)合位點(diǎn)解析為各個(gè)核苷酸,并提高了位于重復(fù)基序內(nèi)的結(jié)合位點(diǎn)的準(zhǔn)確性。

trilinkbiotech免疫沉淀產(chǎn)品

3' iCLIP Primer

Cat #: O-30050

3' iCLIP Primer - (O-30050)

 

SKUUnit Size
O-30050-033 nmole
O-30050-093 x 3 nmole

 

描述

PO DNA,5'(rApp)AGA TCG GAA GAG CGG TTC AG(ddC)3'UV交聯(lián)和免疫沉淀(CLIP)的開發(fā)可鑒定RNA-蛋白質(zhì)相互作用(Ule J等,2003)。該方法涉及RNA與蛋白質(zhì)的不可逆交聯(lián),免疫沉淀,5'和3'銜接子的連接,逆轉(zhuǎn)錄以及后的PCR擴(kuò)增。不幸的是,CLIP受到限制,因?yàn)槟孓D(zhuǎn)錄酶無(wú)法讀取交聯(lián)區(qū)域。這樣就創(chuàng)建了不需要啟動(dòng)PCR擴(kuò)增所需的3'和5'銜接子的截短的cDNA。雖然存在多種CLIP方法版本,但單個(gè)核苷酸分辨率的UV交聯(lián)和免疫沉淀(iCLIP)具有許多優(yōu)勢(shì)。iCLIP解決了截短cDNA擴(kuò)增差的問(wèn)題。這可以通過(guò)使用預(yù)腺苷酸化引物(iCLIP引物)和逆轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物的環(huán)化來(lái)實(shí)現(xiàn)。該方法還解析了與單個(gè)核苷酸的結(jié)合位點(diǎn),并提高了位于重復(fù)基序內(nèi)的結(jié)合位點(diǎn)的準(zhǔn)確性(Konig J et al。2010.,Konig J et al。2011)。

產(chǎn)品詳情

貨號(hào)O-30050
質(zhì)量控制通過(guò)
骨干磷酸二酯
序列5(rApp)AGA TCG GAA GAG CGG TTC AG(ddC)3
推薦儲(chǔ)存-20°C以下
應(yīng)用下一代測(cè)序(NGS)

 

 

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